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基于家系的疾病基因定位

       基于STR的家系連鎖分析對(duì)較為完整的單基因疾病家系進(jìn)行分析,通過(guò)鑒定與目的表型共同遺傳的微衛(wèi)星標(biāo)記來(lái)定位致病位點(diǎn),研究表型的致病原因。
 
技術(shù)方法:
疾病基因定位是利用挑選出來(lái)的在全基因組均勻分布的高度多態(tài)的STR位點(diǎn)為Marker,對(duì)家系遺傳的單基因突變導(dǎo)致的疾病通過(guò)連鎖分析進(jìn)行全基因組定位,以進(jìn)一步尋找導(dǎo)致該疾病的基因和突變。該方法主要是利用熒光標(biāo)記的PCR引物對(duì)多個(gè)微衛(wèi)星多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行擴(kuò)增,然后采用高分辨率膠電泳(如用于測(cè)序的毛細(xì)管電泳等)對(duì)擴(kuò)增片斷進(jìn)行分離,通過(guò)熒光檢測(cè)系統(tǒng)(如ABI測(cè)序儀)確定擴(kuò)增片斷的長(zhǎng)度,實(shí)現(xiàn)對(duì)微衛(wèi)星多態(tài)位點(diǎn)的分型。得到的數(shù)據(jù)進(jìn)行家系連鎖分析,根據(jù)各個(gè)位置的LOD值得到致病基因的候選區(qū)域。其主要特點(diǎn)為能快速方便準(zhǔn)確的定位致病基因位置,比起全基因組測(cè)序來(lái)尋找突變的方法成本低非常多,能檢測(cè)出倒位,大片段缺失等測(cè)序無(wú)法檢測(cè)出的情況。
 
應(yīng)用領(lǐng)域:
單基因突變導(dǎo)致的家系遺傳疾??;表型可以明確分辨;有一定數(shù)量的有效家系樣本個(gè)數(shù)。
 
檢測(cè)對(duì)象:
家系個(gè)體的基因組DNA
 
服務(wù)內(nèi)容:
  1. 全基因組STR位點(diǎn)的分型實(shí)驗(yàn)。
  2. STR分型結(jié)果判讀。
  3. 根據(jù)家系進(jìn)行連鎖分析。
檢測(cè)實(shí)例:
ChrX遺傳病家系定位STR分型膠圖

致病基因定位分析整體圖(ChrN)

致病基因定位分析局部圖

家系單倍型圖:
 
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