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基因組DNA常規(guī)測(cè)序

       針對(duì)目的個(gè)體在已知的DNA區(qū)段或者候選基因區(qū)域進(jìn)行序列測(cè)定,獲得區(qū)域的序列并尋找未知的突變或者多態(tài)。
 
技術(shù)方法:
針對(duì)目的片段進(jìn)行特異性擴(kuò)增引物設(shè)計(jì),利用引物對(duì)目的片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增,后采用美國(guó)Life technologies公司的BigDye試劑盒對(duì)純化后的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行序列測(cè)定(見圖1)。該測(cè)序的基本原理是雙脫氧終止法,在測(cè)序反應(yīng)體系中含有四種dNTP以及一定比例的標(biāo)記不同熒光的四種ddNTP, 在測(cè)序聚合酶作用下,結(jié)合在PCR產(chǎn)物模板上的測(cè)序引物開始延伸,由于ddNTP的隨機(jī)摻入,不同PCR產(chǎn)物模板分子上的延伸反應(yīng)可隨機(jī)停留在整個(gè)序列的不同位置,這些由于3’端熒光ddNTP的摻入而帶上特定熒光的不同長(zhǎng)度延伸產(chǎn)物在ABI測(cè)序儀(3130XL, 3730XL)上經(jīng)毛細(xì)管電泳獲得分離,通過分析一系列長(zhǎng)度片段的熒光信號(hào)可以獲知目標(biāo)片段上的序列組成。

圖一:測(cè)序突變篩查原理圖。
 
 
應(yīng)用領(lǐng)域:
單基因多基因遺傳疾病的基因突變檢測(cè)、藥物代謝相關(guān)基因突變檢測(cè)、候選基因多態(tài)位點(diǎn)檢測(cè)及遺傳結(jié)構(gòu)分析、腫瘤相關(guān)基因的體細(xì)胞突變檢測(cè)、耐藥微生物菌株的突變檢測(cè)等
 
樣本要求:
不同來(lái)源的基因組DNA,可以來(lái)自血液、組織或各種病原微生物等。
 
服務(wù)內(nèi)容:
1、目標(biāo)基因序列查詢、特異引物設(shè)計(jì)、合成與優(yōu)化;
2、目的片段的擴(kuò)增、純化;
3、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序;
4、判讀測(cè)序結(jié)果,讀取突變或多態(tài)位點(diǎn);
5、突變(SNP)位點(diǎn)數(shù)據(jù)整理、分析以及突變位點(diǎn)測(cè)序圖制作;
6、對(duì)于候選基因多態(tài)位點(diǎn)檢測(cè)項(xiàng)目,提供LD map分析、單倍型推斷以及tagSNP位點(diǎn)篩選。
 
服務(wù)時(shí)間:
通常情況下,<30樣本一個(gè)基因測(cè)序需15個(gè)工作日
檢測(cè)實(shí)例:
1.查找序列,標(biāo)注基因,待查位點(diǎn),設(shè)計(jì)引物。

 
2.利用軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析,在不同個(gè)體中尋找序列差異和突變位點(diǎn)。

 
3. 準(zhǔn)確提供篩查到的突變/SNP信息(非真實(shí)數(shù)據(jù),僅供模式參考)

 
4. 可直接提供連鎖不平衡結(jié)構(gòu)分析圖 。

 
  1. 5. 典型突變位點(diǎn)測(cè)序截圖供客戶方便課題總結(jié)。

 
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