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英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

The pervasive effects of   an antibiotic on the human gut microbiota,   as revealed by deep 16S rRNA sequencing

PLoS Biology

4.587 

2008

個(gè)人在服用環(huán)丙沙星前后糞便樣本

細(xì)菌16S rDNA V3，V6區(qū)測(cè)序

Towards the Human   Colorectal Cancer Microbiome

Plos one

3.057

2011

來自6個(gè)接受了切除手術(shù)的原發(fā)性結(jié)腸腺癌患者癌組織和和癌旁粘膜樣品

細(xì)菌16S rDNA V1-V3區(qū)測(cè)序

Structural segregation of gut   microbiota between colorectal cancer patients and healthy   volunteers

The ISME Journa

9.328

2012

46例結(jié)直腸癌患者和56例健康對(duì)照志愿者的糞便樣品

細(xì)菌16S rDNA V3區(qū)測(cè)序

Co-occurrence of   driver and passenger bacteria in human colorectal cancer

Gut Pathogens

2.816 

2014

正常腸道組織樣本（ｎ＝10），腺瘤性息肉組織樣本（ｎ＝10），腫瘤組織樣本（ｎ＝8）

細(xì)菌16S rDNA V1-V2區(qū)測(cè)序

Impacts of   infection with different toxigenic Clostridium difficile strains on faecal   microbiota in children

Scientific Reports 

5.228

2014

28-48月大的14個(gè) (CDAD A+B+)感染兒童，23個(gè) (CDAD A–B+)感染兒童，43個(gè)健康兒童糞便

細(xì)菌16S rDNA V1-V3區(qū)測(cè)序

英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

Insights   into the respiratory tract microbiota of patients with cystic   fibrosis during early Pseudomonas aeruginosa colonization

Springer Plus

0.982 

2015

5個(gè)囊性纖維化患者16–39 個(gè)月的20個(gè)痰樣本

細(xì)菌16S rDNA V3-V4區(qū)測(cè)序

Composition and   dynamics of the respiratory tract microbiome in intubated patients

Microbiome

9.0

2016

15個(gè)呼吸衰竭受試者的上呼吸道口咽和深部氣管分泌物樣本

細(xì)菌16S rDNA V6區(qū)測(cè)序

Dysbiosis of upper respiratory tract   microbiota in elderly pneumonia patients

The ISME Journa

9.328

2016

100位年齡》60歲的老年肺炎患者，27位年齡18歲-60歲的青年肺炎患者；91位健康的老年人和187位健康的青年人的口咽樣本

細(xì)菌16S rDNA V5-V7區(qū)測(cè)序

英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

Temporal and   spatial variation of the human microbiota during pregnancy

PNAS

9.423 

2015

49名18歲及以上的孕婦每一周以及產(chǎn)后的陰道、大便、唾液和牙齒/牙齦樣本

細(xì)菌16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序

Cervicovaginal   Bacteria Are a Major Modulator of Host Inflammatory Responses in the Female   Genital Tract

Immunity

24.082

2015

94個(gè)無癥狀婦女陰道陰道棉簽擦拭樣品

細(xì)菌16S rDNA V4區(qū)擴(kuò)增子測(cè)序

Metabolicsignatures   of bacterial vaginosis

mBIO

6.786

2015

40個(gè)健康女性和20個(gè)細(xì)菌性陰道炎患者的聚氨酯泡沫拭子、陰道灌洗液、子宮頸灌洗液

細(xì)菌16S rDNA V3-V4區(qū)測(cè)序

英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

A Filifactor   alocis-centered co-occurrence group associates with periodontitis across   different oral habitats

Scientific Reports 

5.228

2015

牙周炎患者和健康志愿者的唾液，牙齦上菌斑，牙齦下菌斑樣品

細(xì)菌16S rDNA V3-V4區(qū)測(cè)序

Prediction of Early   Childhood Caries via Spatial-Temporal Variations of Oral Microbiota

Cell Host   & Microbe

12.552

2015

未患齲齒兒童；患有輕微齲齒兒童；患有嚴(yán)重齲齒兒童的唾液和牙菌斑樣品

細(xì)菌16S rDNA V1-V3區(qū)測(cè)序

Cigarette smoking   and the oral microbiome in a large study of American adults

The ISME Journal

9.328

2016

從未吸過煙的志愿者；有過吸煙史但已戒煙的志愿者；一直吸煙志愿者的口腔樣本

細(xì)菌16S rDNA V3-V4區(qū)測(cè)序

英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

Topographic persity   of fungal and bacterial communities in human skin

Nature

38.138 

2013

十位健康成年人身上收集的易發(fā)生真菌性皮膚病的十四個(gè)皮膚部位拭子樣本

細(xì)菌16S rDNA V3-V4區(qū)測(cè)序；真菌18SrDNA V1-V6區(qū)擴(kuò)增子測(cè)序，；真菌ITS1擴(kuò)增子測(cè)序

Intestinal   microbiome analyses identify melanoma patients at risk for   checkpoint-blockade-induced colitis

Nature communications

11.329 

2016

34名患黑色素瘤并且接受依普利姆瑪治療的病人糞便樣本（24名沒有患腸炎；10名患腸炎組）

細(xì)菌16S rDNA V4-V5區(qū)測(cè)序

英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

Decreased Bacterial   Diversity Characterizes the Altered Gut Microbiota in Patients With Psoriatic   Arthritis, Resembling Dysbiosis in Inflammatory Bowel Disease

Arthritis Rheumatol

6.009

2015

17個(gè)銀屑病關(guān)節(jié)炎患者，15個(gè)牛皮癬患者，17個(gè)健康志愿者糞便樣品

細(xì)菌16S rDNA V1-V2區(qū)測(cè)序；

Intestinal   Dysbiosis in Ankylosing Spondylitis

Arthritis Rheumatol

6.009

2015

9個(gè)強(qiáng)直性脊柱炎患者，9個(gè)健康對(duì)照的糞便樣品

細(xì)菌16S rDNA V4區(qū)測(cè)序

英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

Human oral, gut,   and plaque microbiota in patients with atherosclerosis

PNAS

9.423 

2015

15個(gè)正常人和15個(gè)動(dòng)脈粥樣硬化患者的動(dòng)脈粥樣硬化斑塊，腸道，口腔樣本

細(xì)菌16S rDNA V1-V2區(qū)測(cè)序

Microbiota Dysbiosis   Controls the Neuroinflammatory Response after Stroke

The Journal of Neuroscience

5.924 

2016

誘導(dǎo)中風(fēng)小鼠和正常小鼠的糞便樣本

細(xì)菌16S rDNA V1-V3區(qū)測(cè)序

Commensal   microbiota affects ischemic stroke outcome by regulating intestinal γδ T   cells

Nature medicine

30.357 

2015 

利用抗生素清除腸道微生物后的小鼠和一組對(duì)照小鼠的糞便樣本，然后中風(fēng)誘導(dǎo)

細(xì)菌16S rDNA V4-V5區(qū)測(cè)序

英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

Reduced diversity   and altered composition of the gut microbiome in individuals with myalgic   encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome

Microbiome

9.0

2016

48例肌痛性腦脊髓炎/慢性疲勞綜合征患者和39例對(duì)照受試者的糞便樣品

細(xì)菌16S rDNA V4區(qū)測(cè)序

Reduced incidence   of Prevotella and other fermenters in intestinal microflora   of autistic children

Plos one

3.057

2013

20名正常人和20個(gè)自閉癥兒童的糞便樣品

細(xì)菌16S rDNA V2-V3區(qū)測(cè)序

Fecal microbiota   and metabolome of children with autism and pervasive   developmental disorder not otherwise specified

Plos one

3.057

2013

10名廣泛性發(fā)展障礙兒童，10名自閉癥兒童和10名正常兒童糞便樣本

細(xì)菌16S rDNA V1-V3區(qū)測(cè)序

英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

The Microbiome of   Aseptically Collected Human Breast Tissue in Benign and Malignant Disease

Scientific Reports 

5.228

2016

乳腺癌患者和良性腫瘤的乳腺組織，乳房皮膚組織，乳房皮膚和口腔黏膜樣品

細(xì)菌16S rDNA V3-V5區(qū)測(cè)序

The microbiota of   breast tissue and its association with tumours 

Appl.Environ. Microbiol.

3.823

2016

乳腺癌患者癌旁正常組織和健康對(duì)照組的組織

細(xì)菌16S rDNA V6區(qū)測(cè)序

英文題目

期刊名稱

影響因子

發(fā)表時(shí)間

實(shí)驗(yàn)樣品

測(cè)序策略

A core gut microbiome in obese and lean twins

Nature

38.138 

2009

胖瘦不同的同卵雙胞胎（31對(duì)）、異卵雙胞胎（23對(duì)）及其母親（46個(gè)）的糞便樣本

細(xì)菌16S rDNA V2,V6區(qū)測(cè)序

Gut microbiota in human adults with type 2 diabetes differs from non-diabetic adults

Plos one

3.057

2010

Ⅱ型糖尿病男性患者18人，正常男性18人的糞便樣本

細(xì)菌16S rDNA V4-V6區(qū)測(cè)序

Fecal microbiota   imbalance in Mexican children with type 1 diabetes

Scientific Reports 

5.228

2014

8 例健康兒童，8 例初發(fā) I 型糖尿病患者，

以及 13 例已治療兩年的 I 型糖尿病患者的糞便樣本

細(xì)菌16S rDNA V4區(qū)測(cè)序

The stool   microbiota of insulin resistant women with recent gestational diabetes, a   high risk group for type 2 diabetes

Scientific Reports 

5.228

2015

分娩3-16個(gè)月后的42名妊娠期糖尿病患者和35名健康者糞便樣品

細(xì)菌16S rDNA V4區(qū)測(cè)序