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Illumina GAIIx


圖1. Illumina GAIIx
       高速基因分析系統(tǒng)GAIIx(Solexa)測序是一種基于單分子簇的邊合成邊測序技術(shù),它基于專有的可逆終止化學(xué)反應(yīng)原理。2006年Solexa公司被Illumina公司收購,后被重新命名為Illumina Genome Analyzer。作為新一代分子生物學(xué)綜合技術(shù)平臺(tái),Genome Analyzer測序技術(shù)避免了像傳統(tǒng)測序技術(shù)那樣耗費(fèi)大量人力、物力進(jìn)行片段克隆、轉(zhuǎn)化、質(zhì)粒抽提等工作,具有高準(zhǔn)確性,高通量,高靈敏度,低運(yùn)行成本等突出優(yōu)勢,是目前市場占有率最高的第二代高通量基因測序儀。

測序原理:
測序時(shí)將基因組DNA的隨機(jī)片段附著到光學(xué)透明的玻璃表面(即Flow cell),這些DNA片段經(jīng)過延伸和橋式擴(kuò)增后,在Flow cell上形成了數(shù)以億計(jì)Cluster,每個(gè)Cluster是具有數(shù)千份相同模板的單分子簇。然后利用帶熒光基團(tuán)的四種特殊脫氧核糖核苷酸,通過可逆性終止的SBS(邊合成邊測序)技術(shù)對(duì)待測的模板DNA進(jìn)行測序。這種新方法確保了高精確度和真實(shí)的一個(gè)堿基接一個(gè)堿基的測序,排除序列方面的特殊錯(cuò)誤,為同聚物和重復(fù)序列的測序提供了一個(gè)很好的解決方案。
性能特點(diǎn):
• 測序通量高:每個(gè)測序反應(yīng)能達(dá)到90G以上的數(shù)據(jù)通量;
• 準(zhǔn)確率高: ≥ 98.5%,同時(shí)也有效地解決了多聚重復(fù)序列的讀取問題;
• 低成本:比傳統(tǒng)毛細(xì)管測序技術(shù)成本的1%還低;
• DNA序列的讀取長度不斷增加,當(dāng)前達(dá)到300 bp;
• 可以進(jìn)行Pair-End雙向測序,目前Pair-End文庫插入片段大小范圍可由200bp到10kb;
• 每張芯片有8個(gè)通道,每個(gè)通道可單獨(dú)測序一個(gè)樣品,也可以把多個(gè)樣品混合在一起測序。
應(yīng)用領(lǐng)域:
• 全基因組測序(重測序)
• BAC重測序
• 轉(zhuǎn)錄組測序
• 宏基因組測序
• 基因表達(dá)譜
• 小RNA測序
• ChIP-Seq測序
 
 
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