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AccuCopy——準(zhǔn)確快速CNV多重檢測新技術(shù)

本試劑盒采用上海天昊生物科技有限公司開發(fā)的AccuCopy®多重基因拷貝數(shù)檢測專利技術(shù),根據(jù)客戶項(xiàng)目要求合成特異引物和競爭模板,以及優(yōu)化PCR反應(yīng)體系后組裝而成。

該專利技術(shù)原理說明見圖1:取一定量的競爭DNA片段混合物----每個(gè)片段與各自對(duì)應(yīng)基因片段僅有微小差別(通常為幾個(gè)堿基長度差異),然后與合適量的樣本DNA混合,作為隨后多重?zé)晒飧偁幮訮CR擴(kuò)增的模板;多重PCR產(chǎn)物經(jīng)毛細(xì)管電泳后對(duì)不同基因位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物以及同一位點(diǎn)的不同模板(樣本DNA與競爭DNA)擴(kuò)增產(chǎn)物根據(jù)其長度差異進(jìn)行分離;分析每個(gè)基因片段的S/I值,利用參照基因S/I值對(duì)目標(biāo)基因S/I值進(jìn)行校正后獲取目標(biāo)基因的準(zhǔn)確拷貝數(shù)。 與其它拷貝數(shù)檢測技術(shù)如qRT-PCR和MLPA相比,該檢測專利技術(shù)具備低成本、高效率、高準(zhǔn)確性的優(yōu)勢。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用ABI3130XL進(jìn)行毛細(xì)管電泳,原始數(shù)據(jù)文件采用GeneMapper4.0(Appliedbiosystems)進(jìn)行目標(biāo)峰高及峰面積數(shù)據(jù)讀取,輸出數(shù)據(jù)采用EXCEL進(jìn)行處理分析。
 
1 AccuCopy®多重CNV檢測技術(shù)原理:利用內(nèi)對(duì)照DNA校正不同片段的擴(kuò)增效率的差異,參照基因R來作為2拷貝的內(nèi)參基因,用于拷貝數(shù)絕對(duì)定量。數(shù)據(jù)處理時(shí),使用目的峰面積S/內(nèi)對(duì)照DNA峰I,再用參照基因R進(jìn)行標(biāo)化2拷貝,目的基因片段的拷貝數(shù)便可以精確定量了。

圖2:AccuCopy®在1個(gè)體系中進(jìn)行10個(gè)目的片段多重定量檢測的熒光毛細(xì)管電泳圖。
 
 
圖3各種基因拷貝數(shù)檢測技術(shù)的參數(shù)比較
 
天昊生物自主專利技術(shù)
◣多重檢測可將12個(gè)片段融入1個(gè)檢測體系,其中9個(gè)檢測目的片段,3個(gè)參照基因片段。
◣最為準(zhǔn)確的CNV拷貝數(shù)定量檢測方法,平均檢測誤差<5%。
◣高靈敏度:可以準(zhǔn)確定量高達(dá)6個(gè)拷貝的目的片段。
◣高通量:實(shí)驗(yàn)反應(yīng)只需4個(gè)小時(shí)。
◣低成本:無需大量重復(fù),多重實(shí)驗(yàn)為您大大節(jié)省實(shí)驗(yàn)成本。
◣高靈活性:可根據(jù)客戶需求進(jìn)行設(shè)計(jì)合成Customer Design Panel及試劑盒,您只需擁有熒光毛細(xì)管電泳儀就可以輕松實(shí)現(xiàn)高效的拷貝數(shù)多重檢測。省去繁瑣的國外定制流程,更快速、更便宜。
 
 
研究實(shí)例:

圖4:AccuCopy®檢測實(shí)例I:染色體21、X、Y拷貝數(shù)檢測,參照基因POP1
 
Catalogue No. 包裝
CN0105KS 250個(gè)反應(yīng)
CN0105KM 500個(gè)反應(yīng)
CN0105KL 1000個(gè)反應(yīng)
試劑盒定制流程:
  1. 提供相應(yīng)數(shù)量的CNV及其在GRCh37版本數(shù)據(jù)庫中染色體上的相應(yīng)位置。
  2. 利用軟件初步設(shè)計(jì)CNV之后與客戶聯(lián)系確定最終納入AccuCopy檢測體系的CNV探針位置。
  3. 客戶確認(rèn)檢測體系信息后,簽訂試劑定制合同,將客戶確認(rèn)的體系信息提交生產(chǎn)部,定制產(chǎn)品全款到賬后生產(chǎn)部立即開始合成生產(chǎn)。
  4. 產(chǎn)品生產(chǎn)完畢后,我們會(huì)立即通知客戶安排發(fā)貨。
 
試劑盒中包括具體的試劑說明、標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)體系條件、所需實(shí)驗(yàn)儀器列表、數(shù)據(jù)判讀方法和標(biāo)準(zhǔn),但不包含數(shù)據(jù)判讀所用軟件。
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